Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP1P09455 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBP1P09455 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP1P09455 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBP1P09455 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP1P09455 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP1P09455 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP1P09455 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBP1P09455 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP1P09455 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP1P09455 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP1P09455 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBP1P09455 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP1P09455 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP1P09455 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP1P09455 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBP1P09455 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP1P09455 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBP1P09455 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP1P09455 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBP1P09455 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP1P09455 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP1P09455 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP1P09455 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBP1P09455 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBP1P09455 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP1P09455 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBP1P09455 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP1P09455 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP1P09455 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP1P09455 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBP1P09455 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP1P09455 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP1P09455 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP1P09455 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBP1P09455 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBP1P09455 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBP1P09455 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBP1P09455 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBP1P09455 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBP1P09455 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP1P09455 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP1P09455 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP1P09455 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBP1P09455 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBP1P09455 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP1P09455 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBP1P09455 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP1P09455 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP1P09455 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP1P09455 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBP1P09455 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP1P09455 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP1P09455 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP1P09455 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP1P09455 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBP1P09455 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP1P09455 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP1P09455 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBP1P09455 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms