Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRM2P04554 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRM2P04554 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRM2P04554 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRM2P04554 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRM2P04554 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRM2P04554 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRM2P04554 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRM2P04554 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRM2P04554 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRM2P04554 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRM2P04554 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRM2P04554 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRM2P04554 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRM2P04554 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRM2P04554 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRM2P04554 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRM2P04554 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRM2P04554 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM2P04554 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM2P04554 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRM2P04554 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM2P04554 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM2P04554 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM2P04554 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRM2P04554 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM2P04554 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM2P04554 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM2P04554 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM2P04554 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM2P04554 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM2P04554 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM2P04554 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRM2P04554 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRM2P04554 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRM2P04554 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRM2P04554 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRM2P04554 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRM2P04554 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRM2P04554 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRM2P04554 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRM2P04554 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRM2P04554 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRM2P04554 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRM2P04554 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRM2P04554 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRM2P04554 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRM2P04554 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRM2P04554 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRM2P04554 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRM2P04554 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRM2P04554 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRM2P04554 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRM2P04554 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRM2P04554 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRM2P04554 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms