Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCATP04180 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCATP04180 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCATP04180 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCATP04180 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCATP04180 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCATP04180 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCATP04180 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCATP04180 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCATP04180 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCATP04180 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCATP04180 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCATP04180 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCATP04180 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCATP04180 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCATP04180 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LCATP04180 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCATP04180 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCATP04180 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCATP04180 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCATP04180 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCATP04180 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCATP04180 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCATP04180 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCATP04180 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCATP04180 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCATP04180 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCATP04180 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCATP04180 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCATP04180 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCATP04180 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCATP04180 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCATP04180 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCATP04180 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCATP04180 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCATP04180 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCATP04180 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCATP04180 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCATP04180 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCATP04180 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCATP04180 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCATP04180 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCATP04180 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCATP04180 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCATP04180 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCATP04180 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCATP04180 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCATP04180 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCATP04180 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCATP04180 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCATP04180 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCATP04180 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCATP04180 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCATP04180 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCATP04180 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LCATP04180 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCATP04180 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCATP04180 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCATP04180 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCATP04180 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCATP04180 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCATP04180 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCATP04180 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCATP04180 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCATP04180 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms