Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1RP00736 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1RP00736 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1RP00736 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C1RP00736 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C1RP00736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1RP00736 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1RP00736 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1RP00736 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1RP00736 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1RP00736 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1RP00736 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C1RP00736 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1RP00736 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1RP00736 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1RP00736 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C1RP00736 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C1RP00736 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1RP00736 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1RP00736 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1RP00736 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1RP00736 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1RP00736 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C1RP00736 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C1RP00736 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1RP00736 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1RP00736 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1RP00736 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1RP00736 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1RP00736 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C1RP00736 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C1RP00736 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1RP00736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1RP00736 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1RP00736 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1RP00736 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C1RP00736 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1RP00736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1RP00736 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1RP00736 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1RP00736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1RP00736 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1RP00736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1RP00736 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1RP00736 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1RP00736 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1RP00736 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C1RP00736 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1RP00736 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1RP00736 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1RP00736 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1RP00736 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C1RP00736 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1RP00736 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1RP00736 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1RP00736 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1RP00736 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1RP00736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1RP00736 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1RP00736 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1RP00736 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1RP00736 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C1RP00736 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1RP00736 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1RP00736 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1RP00736 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1RP00736 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1RP00736 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1RP00736 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1RP00736 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1RP00736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1RP00736 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1RP00736 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1RP00736 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms