Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL3O95236 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL3O95236 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL3O95236 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL3O95236 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL3O95236 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL3O95236 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL3O95236 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL3O95236 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL3O95236 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL3O95236 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL3O95236 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL3O95236 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL3O95236 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL3O95236 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL3O95236 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL3O95236 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL3O95236 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL3O95236 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL3O95236 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL3O95236 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL3O95236 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL3O95236 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL3O95236 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL3O95236 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL3O95236 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL3O95236 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL3O95236 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL3O95236 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL3O95236 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL3O95236 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL3O95236 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL3O95236 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL3O95236 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL3O95236 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL3O95236 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL3O95236 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL3O95236 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL3O95236 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL3O95236 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL3O95236 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL3O95236 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL3O95236 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL3O95236 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL3O95236 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL3O95236 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL3O95236 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL3O95236 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL3O95236 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL3O95236 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL3O95236 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL3O95236 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL3O95236 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL3O95236 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL3O95236 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOL3O95236 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOL3O95236 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOL3O95236 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL3O95236 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOL3O95236 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL3O95236 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL3O95236 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL3O95236 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL3O95236 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOL3O95236 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOL3O95236 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOL3O95236 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL3O95236 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOL3O95236 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL3O95236 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL3O95236 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL3O95236 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL3O95236 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOL3O95236 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOL3O95236 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms