Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPO95166 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABARAPO95166 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABARAPO95166 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABARAPO95166 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms