Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR47O94967 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR47O94967 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR47O94967 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR47O94967 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR47O94967 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR47O94967 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR47O94967 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR47O94967 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR47O94967 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR47O94967 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR47O94967 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR47O94967 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR47O94967 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR47O94967 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR47O94967 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR47O94967 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR47O94967 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR47O94967 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR47O94967 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR47O94967 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR47O94967 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR47O94967 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR47O94967 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR47O94967 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR47O94967 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR47O94967 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR47O94967 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR47O94967 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR47O94967 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR47O94967 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR47O94967 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR47O94967 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR47O94967 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR47O94967 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR47O94967 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR47O94967 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR47O94967 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR47O94967 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR47O94967 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR47O94967 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR47O94967 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR47O94967 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR47O94967 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR47O94967 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR47O94967 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR47O94967 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR47O94967 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR47O94967 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR47O94967 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR47O94967 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR47O94967 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR47O94967 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR47O94967 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR47O94967 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR47O94967 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR47O94967 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR47O94967 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR47O94967 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR47O94967 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR47O94967 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR47O94967 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR47O94967 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR47O94967 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR47O94967 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR47O94967 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR47O94967 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR47O94967 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR47O94967 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR47O94967 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR47O94967 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR47O94967 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR47O94967 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR47O94967 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR47O94967 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms