Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN15O75808 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPN15O75808 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPN15O75808 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN15O75808 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN15O75808 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms