Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1O75570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MTRF1O75570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MTRF1O75570 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MTRF1O75570 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms