Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRCH4O75427 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRCH4O75427 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRCH4O75427 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH4O75427 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH4O75427 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms