Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP12O75317 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP12O75317 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP12O75317 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP12O75317 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP12O75317 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP12O75317 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP12O75317 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP12O75317 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP12O75317 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP12O75317 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP12O75317 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP12O75317 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP12O75317 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP12O75317 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP12O75317 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP12O75317 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP12O75317 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP12O75317 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP12O75317 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP12O75317 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP12O75317 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP12O75317 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP12O75317 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP12O75317 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP12O75317 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP12O75317 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP12O75317 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP12O75317 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP12O75317 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP12O75317 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP12O75317 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP12O75317 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP12O75317 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP12O75317 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP12O75317 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP12O75317 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP12O75317 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP12O75317 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP12O75317 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP12O75317 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP12O75317 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP12O75317 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP12O75317 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP12O75317 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP12O75317 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP12O75317 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP12O75317 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP12O75317 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP12O75317 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP12O75317 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP12O75317 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP12O75317 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP12O75317 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP12O75317 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP12O75317 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP12O75317 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP12O75317 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP12O75317 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP12O75317 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP12O75317 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP12O75317 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP12O75317 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP12O75317 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP12O75317 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP12O75317 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP12O75317 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP12O75317 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP12O75317 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP12O75317 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP12O75317 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP12O75317 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP12O75317 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms