Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3BO75182 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIN3BO75182 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIN3BO75182 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIN3BO75182 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms