Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2O75044 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2O75044 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRGAP2O75044 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2O75044 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms