Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LANCL1O43813 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LANCL1O43813 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LANCL1O43813 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LANCL1O43813 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LANCL1O43813 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms