Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOK3O14730 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOK3O14730 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RIOK3O14730 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RIOK3O14730 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK3O14730 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK3O14730 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOK3O14730 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK3O14730 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOK3O14730 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOK3O14730 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK3O14730 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK3O14730 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK3O14730 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK3O14730 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOK3O14730 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK3O14730 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RIOK3O14730 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIOK3O14730 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RIOK3O14730 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RIOK3O14730 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIOK3O14730 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms