Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms