Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM25AB3EWG3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM25AB3EWG3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM25AB3EWG3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM25AB3EWG3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms