Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBD1B2RD01 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBD1B2RD01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBD1B2RD01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPBD1B2RD01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms