Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MEIS3P1A6NDR6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MEIS3P1A6NDR6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MEIS3P1A6NDR6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MEIS3P1A6NDR6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEIS3P1A6NDR6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEIS3P1A6NDR6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms