Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHIC2Q9UKJ5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms