Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFCP2L1Q9NZI6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms