Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMIM3Q9BZL3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMIM3Q9BZL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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