Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00208Q96KT6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms