Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PRAC1Q96KF2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PRAC1Q96KF2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms