Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTBP2P56545 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms