Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL35P42766 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms