Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 LYPD4-203ENST00000609812 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 LAMC2-201ENST00000264144 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 JAM2-206ENST00000480456 4337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF594-202ENST00000575779 4335 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM231-201ENST00000258173 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 XPNPEP2-202ENST00000371106 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 EFHC1-213ENST00000635996 2548 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 POU3F4-201ENST00000373200 3878 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NFYA-201ENST00000341376 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP4-11Q9BYQ6 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF182-204ENST00000488300 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 STX16-203ENST00000358029 4329 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF559-206ENST00000587557 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC011365.1-201ENST00000522615 3478 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CARMN-201ENST00000505254 3950 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC138951.1-201ENST00000502532 2685 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GGA3-202ENST00000538886 3766 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C9orf131-202ENST00000354479 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GAPVD1-219ENST00000495955 5309 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AHI1-202ENST00000327035 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC01498-201ENST00000502160 2984 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms