Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01558Q9Y6Z2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01558Q9Y6Z2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms