Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTLC3Q9NUV7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTLC3Q9NUV7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTLC3Q9NUV7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms