Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1BQ9H816 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1BQ9H816 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1BQ9H816 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DCLRE1BQ9H816 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DCLRE1BQ9H816 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms