Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC22CQ9BRL7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC22CQ9BRL7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms