Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP3Q96JB5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms