Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC34Q96HJ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms