Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCL2Q8N4E4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms