Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TYSND1Q2T9J0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TYSND1Q2T9J0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms