Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms