Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MDM2Q00987 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms