Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA1P01562 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms