Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF22A3QJZ6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms