Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GABRB3-201ENST00000299267 4494 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ANO5-201ENST00000324559 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC091167.8-201ENST00000641199 3441 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LOXL3-201ENST00000264094 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC135048.4-201ENST00000624286 3641 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GOSR2-239ENST00000640608 3871 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATXN1L-201ENST00000427980 7886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC6A12-203ENST00000424061 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TPP2-201ENST00000376052 5447 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A8-208ENST00000490799 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPC2-201ENST00000451043 3173 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SYS1-204ENST00000426004 2915 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IKZF5-205ENST00000617859 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTN4-203ENST00000418658 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms