Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC40-204ENST00000397545 4294 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SIDT2-203ENST00000431081 3910 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8EP-202ENST00000620011 5241 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPME1-202ENST00000398427 2496 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGC5-201ENST00000252087 4761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT6-202ENST00000318336 3137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP44-201ENST00000262444 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 THAP5-203ENST00000415914 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM5-202ENST00000607544 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A3-201ENST00000262502 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF780B-201ENST00000221355 3538 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH6-205ENST00000583023 3821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM1-207ENST00000507907 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000356.2-201ENST00000639904 4634 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYRFL-205ENST00000552032 3139 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A7A-203ENST00000368729 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL1-202ENST00000545028 3966 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms