Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 NCAM1-229ENST00000621518 4922 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 AC004877.1-201ENST00000608963 4093 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 SCMH1-208ENST00000397171 3186 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 WISP1-202ENST00000250160 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP5-3Q6L8H2 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ACOXL-AS1-201ENST00000376593 3026 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ESR1-208ENST00000443427 6357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SULF2-211ENST00000484875 4238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 C1orf116-201ENST00000359470 5493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MATN2-208ENST00000520016 3495 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXN4-201ENST00000299162 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 DAZ3-203ENST00000446723 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 DAZ2-209ENST00000449947 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 LRRC7-204ENST00000415775 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 HERC2P4-205ENST00000566902 3957 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR37-202ENST00000358220 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 VWA5B1-202ENST00000375079 3859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 KCNH6-205ENST00000583023 3821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ITGA10-201ENST00000369304 5269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ENTPD1-203ENST00000371207 1903 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 NCAM1-226ENST00000619839 2993 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 TUBB1-201ENST00000217133 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 AC064805.1-202ENST00000569279 3493 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms