Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms