Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM259Q4ZIN3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms