Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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