Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRIP13Q15645 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRIP13Q15645 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRIP13Q15645 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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TRIP13Q15645 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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TRIP13Q15645 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIP13Q15645 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms