Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRADDQ15628 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRADDQ15628 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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