Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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PTPAQ15257 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPAQ15257 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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