Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CYP4F12-209ENST00000547471 573 ntTSL 410.91□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 QARS-208ENST00000459870 1317 ntTSL 513□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 QARS-207ENST00000453392 859 ntTSL 58.86□□□□□ -0.999e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RHEBL1-204ENST00000550797 1261 ntTSL 1 (best)17.3■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RHEBL1-202ENST00000420065 1063 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ZNF207-212ENST00000580759 572 ntTSL 510.21□□□□□ -0.772e-18■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ZNF207-210ENST00000579634 580 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-18■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ZNF207-214ENST00000582165 592 ntTSL 57.79□□□□□ -1.162e-18■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.772e-18■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 AC005899.4-202ENST00000578389 429 ntTSL 22.35□□□□□ -2.032e-18■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 212.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ALDOC-206ENST00000578590 839 ntTSL 410.52□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 TRAF4-211ENST00000478021 718 ntTSL 321.73■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NXF1-214ENST00000533048 922 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NXF1-215ENST00000533440 579 ntTSL 27.13□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 IFRD2-211ENST00000483071 694 ntTSL 38.53□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 215.2■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.728e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NDRG2-223ENST00000553867 848 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NDRG2-213ENST00000449431 545 ntTSL 47.98□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.427e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.367e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 323.41■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 217.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 POLD1-203ENST00000593887 695 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 ZFYVE21-209ENST00000555501 4453 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.08□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RGS3-219ENST00000478599 4211 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-203ENST00000454220 1233 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 35.5
EFTUD2Q15029 USMG5-202ENST00000337003 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 USMG5-204ENST00000369815 626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.57□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 LYPLA2-206ENST00000420982 614 ntTSL 313.8□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 413.2□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 412.95□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 58.12□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 54.8□□□□□ -1.641e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 511.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.279e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.079e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.869e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 223.5■■□□□ 1.358e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 219.56■□□□□ 0.728e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 217.91■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 45.85□□□□□ -1.478e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 45.56□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.11e-40■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 EPS8L3-206ENST00000477568 493 ntTSL 411.19□□□□□ -0.623e-10■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 IST1-223ENST00000545518 710 ntTSL 211.74□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 IST1-207ENST00000534994 674 ntTSL 59.73□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.374e-8■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 PPT2-EGFL8-204ENST00000453656 1327 ntTSL 216.26■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 35.4
EFTUD2Q15029 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-11■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-11■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 223.42■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 322.37■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 INAVA-203ENST00000451872 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.37■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 LETM1-202ENST00000466175 1626 ntTSL 218.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 IFT172-206ENST00000450564 760 ntTSL 318.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 DGKZ-213ENST00000527903 617 ntTSL 417.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 IFT172-205ENST00000443889 690 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 ZBTB48-201ENST00000319084 1050 ntTSL 316.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 ST3GAL2-206ENST00000567822 689 ntTSL 316.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 ZBTB48-203ENST00000435905 1001 ntTSL 514.38□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 513.91□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 ZBTB48-207ENST00000488936 784 ntTSL 313.84□□□□□ -0.199e-7■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 LETM1-203ENST00000505551 2710 ntTSL 1 (best)13.79□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 LETM1-207ENST00000512669 966 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 WDR34-206ENST00000483181 801 ntTSL 213.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 512.53□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 DYNC1LI2-209ENST00000565532 744 ntTSL 510.91□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 DYNC1LI2-208ENST00000564833 727 ntTSL 410.7□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 35.3
EFTUD2Q15029 DNTTIP1-202ENST00000415790 591 ntTSL 39.45□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 35.3
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