RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319084.9

ZBTB48-201, Transcript of zinc finger and BTB domain containing 48, humanhuman

TSL 3

Gene ZBTB48, Length 1,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB48-201ENST00000319084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.59■■■■■ 4.25
ZBTB48-201ENST00000319084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.91■■■■□ 3.5
ZBTB48-201ENST00000319084 ABCC9O60706 1549 aa36.59■■■■□ 3.45
ZBTB48-201ENST00000319084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.09■■■■□ 3.21
ZBTB48-201ENST00000319084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.91■■■■□ 3.18
ZBTB48-201ENST00000319084 NACADO15069 1562 aa34.8■■■■□ 3.16
ZBTB48-201ENST00000319084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
ZBTB48-201ENST00000319084 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.42■■■■□ 3.1
ZBTB48-201ENST00000319084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
ZBTB48-201ENST00000319084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.26■■■■□ 3.07
ZBTB48-201ENST00000319084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.25■■■■□ 3.07
ZBTB48-201ENST00000319084 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.98■■■■□ 3.03
ZBTB48-201ENST00000319084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.96■■■■□ 3.03
ZBTB48-201ENST00000319084 SCRIBQ14160 1630 aa33.86■■■■□ 3.01
ZBTB48-201ENST00000319084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.29■■■□□ 2.92
ZBTB48-201ENST00000319084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
ZBTB48-201ENST00000319084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.02■■■□□ 2.88
ZBTB48-201ENST00000319084 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.82■■■□□ 2.84
ZBTB48-201ENST00000319084 SMARCA4P51532 1647 aa32.29■■■□□ 2.76
ZBTB48-201ENST00000319084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.21■■■□□ 2.75
ZBTB48-201ENST00000319084 NCAPD3P42695 1498 aa32.17■■■□□ 2.74
ZBTB48-201ENST00000319084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
ZBTB48-201ENST00000319084 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.13■■■□□ 2.73
ZBTB48-201ENST00000319084 SMARCA2P51531 1590 aa32.05■■■□□ 2.72
ZBTB48-201ENST00000319084 HMGXB3Q12766 1538 aa31.9■■■□□ 2.7
ZBTB48-201ENST00000319084 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.9■■■□□ 2.7
ZBTB48-201ENST00000319084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
ZBTB48-201ENST00000319084 WIZO95785 1651 aa31.8■■■□□ 2.68
ZBTB48-201ENST00000319084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
ZBTB48-201ENST00000319084 NESP48681 1621 aa31.64■■■□□ 2.66
ZBTB48-201ENST00000319084 ERCC6Q03468 1493 aa31.45■■■□□ 2.62
ZBTB48-201ENST00000319084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
ZBTB48-201ENST00000319084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.3■■■□□ 2.6
ZBTB48-201ENST00000319084 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.27■■■□□ 2.6
ZBTB48-201ENST00000319084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
ZBTB48-201ENST00000319084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.13■■■□□ 2.57
ZBTB48-201ENST00000319084 CUX2O14529 1486 aa31.09■■■□□ 2.57
ZBTB48-201ENST00000319084 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.06■■■□□ 2.56
ZBTB48-201ENST00000319084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
ZBTB48-201ENST00000319084 CFTRP13569 1480 aa31.01■■■□□ 2.55
ZBTB48-201ENST00000319084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.91■■■□□ 2.54
ZBTB48-201ENST00000319084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
ZBTB48-201ENST00000319084 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.84■■■□□ 2.53
ZBTB48-201ENST00000319084 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.84■■■□□ 2.53
ZBTB48-201ENST00000319084 WDR62O43379 1518 aa30.73■■■□□ 2.51
ZBTB48-201ENST00000319084 PRDM2Q13029 1718 aa30.68■■■□□ 2.5
ZBTB48-201ENST00000319084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ZBTB48-201ENST00000319084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.58■■■□□ 2.49
ZBTB48-201ENST00000319084 TOPBP1Q92547 1522 aa30.4■■■□□ 2.46
ZBTB48-201ENST00000319084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
ZBTB48-201ENST00000319084 ABCC8Q09428 1581 aa30.24■■■□□ 2.43
ZBTB48-201ENST00000319084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
ZBTB48-201ENST00000319084 IFT140Q96RY7 1462 aa30.19■■■□□ 2.42
ZBTB48-201ENST00000319084 CUX1P39880 1505 aa30.13■■■□□ 2.41
ZBTB48-201ENST00000319084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
ZBTB48-201ENST00000319084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.11■■■□□ 2.41
ZBTB48-201ENST00000319084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ZBTB48-201ENST00000319084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.42e-6■■□□□ 12.3
ZBTB48-201ENST00000319084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.04■■■□□ 2.4
ZBTB48-201ENST00000319084 SOGA1O94964 1423 aa30.04■■■□□ 2.4
ZBTB48-201ENST00000319084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
ZBTB48-201ENST00000319084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
ZBTB48-201ENST00000319084 OSCARQ8IYS5 282 aa29.93■■■□□ 2.38
ZBTB48-201ENST00000319084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
ZBTB48-201ENST00000319084 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
ZBTB48-201ENST00000319084 FBLN2P98095 1184 aa29.77■■■□□ 2.36
ZBTB48-201ENST00000319084 TOP2BQ02880 1626 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBTB48-201ENST00000319084 WDR97A6NE52 1622 aa29.72■■■□□ 2.35
ZBTB48-201ENST00000319084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBTB48-201ENST00000319084 CHD1O14646 1710 aa29.7■■■□□ 2.34
ZBTB48-201ENST00000319084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.68■■■□□ 2.34
ZBTB48-201ENST00000319084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.67■■■□□ 2.34
ZBTB48-201ENST00000319084 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
ZBTB48-201ENST00000319084 GRIN2BQ13224 1484 aa29.63■■■□□ 2.33
ZBTB48-201ENST00000319084 TRIM41Q8WV44 630 aa29.6■■■□□ 2.33
ZBTB48-201ENST00000319084 PBRM1Q86U86 1689 aa29.57■■■□□ 2.32
ZBTB48-201ENST00000319084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.57■■■□□ 2.32
ZBTB48-201ENST00000319084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ZBTB48-201ENST00000319084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ZBTB48-201ENST00000319084 SYNJ2O15056 1496 aa29.45■■■□□ 2.31
ZBTB48-201ENST00000319084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.45■■■□□ 2.3
ZBTB48-201ENST00000319084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.45■■■□□ 2.3
ZBTB48-201ENST00000319084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.45■■■□□ 2.3
ZBTB48-201ENST00000319084 ARHGEF11O15085 1522 aa29.39■■■□□ 2.3
ZBTB48-201ENST00000319084 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
ZBTB48-201ENST00000319084 ADAMTS12P58397 1594 aa29.3■■■□□ 2.28
ZBTB48-201ENST00000319084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.29■■■□□ 2.28
ZBTB48-201ENST00000319084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.27■■■□□ 2.28
ZBTB48-201ENST00000319084 GRIN2AQ12879 1464 aa29.26■■■□□ 2.27
ZBTB48-201ENST00000319084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.26■■■□□ 2.27
ZBTB48-201ENST00000319084 IGF1RP08069 1367 aa29.2■■■□□ 2.26
ZBTB48-201ENST00000319084 CEP170Q5SW79 1584 aa29.18■■■□□ 2.26
ZBTB48-201ENST00000319084 ARAP1Q96P48 1450 aa29.17■■■□□ 2.26
ZBTB48-201ENST00000319084 KIF27Q86VH2 1401 aa29.17■■■□□ 2.26
ZBTB48-201ENST00000319084 NUP160Q12769 1436 aa29.12■■■□□ 2.25
ZBTB48-201ENST00000319084 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.08■■■□□ 2.25
ZBTB48-201ENST00000319084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.05■■■□□ 2.24
ZBTB48-201ENST00000319084 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.98■■■□□ 2.23
ZBTB48-201ENST00000319084 JPH4Q96JJ6 628 aa28.96■■■□□ 2.23
ZBTB48-201ENST00000319084 CUL7Q14999 1698 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms